對於牙齦萎縮的防治，要根據不同的類型，採用不同的措施。
老年性萎縮和早老性萎縮要注意口腔衛生、應該用符合全國牙防組織推薦的牙膏及牙刷，每天刷牙2~3次，晚上睡覺前的一次必不可少。在來不及或不方便刷牙時，可用漱口代替。在某些特殊場合裏，可用湯或茶水漱口以保持口腔清潔。防止食物嵌塞，岀現食物嵌塞可刷牙或者用牙線剔除，用牙籤其實並不科學。經常按摩牙齦和叩擊牙齒可以增強局部組織的健康。對於暴露的牙骨質面，應打磨光滑，防止牙菌斑和牙石的沉積牙本質過敏要進行脫敏治療。
炎症性牙齦萎縮要積極防治。如牙周炎、牙結石、口腔潰瘍、牙齦炎、牙齦膿腫、食物嵌塞及不太合適的假牙等，都是刺激並導致牙齦萎縮的原因，所以應定期到醫院檢查治療。對於已經萎縮的牙齦，也可以手術治療。
廢用性萎縮患者要及時改正咬合關係，盡可能恢復個別牙齒的功能，使雙側的牙齒都能有正常的咀嚼功能。
機械性萎縮的預防關鍵是除去局部刺激因素，使用正確的刷牙方法和較細的潔牙劑，注意按摩牙齦。
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