牙齒排列不齊、頜骨畸形的發生，有著複雜的原因。有些是單一因素，有些是多種因素共同參與的結果，維港口腔連鎖箍牙專家表示，造成牙齒畸形的遺傳性以及先天性因素主要如下：
一、遺傳因素
遺傳是生物體的特性，可以從外部形態、內部結構、生理病理等多方面表現岀它的生長狀態。子代和親代之間，形態構造和生理機能等特點有相似之處，這種現象就是遺傳。例如，父母一方的牙頜畸形通過遺傳，孩子也會出現同樣的錯轉。這種因素在牙頜畸形中所占的百分比最高，常見的有上頜前突、下頜前突或後縮、上下頜同時前突（雙頜前突），牙齒排列擁擠等。此外，還有牙齒數目、形態及位置的異常，齶蓋高拱，顱面狹窄等畸形。
二、先天性發育畸形
妊娠期間，母體因疾病或其他某種功能障礙，會影響胎兒的正常發育，造成錯頜畸形。胎兒本身內分泌及新陳代謝失調，也可能發生畸形，這些先天性畸形包括：頜骨發育不足，先天性缺牙，多生牙，融合牙以及唇裂、齶裂、口的畸形等。
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