來自於牙齒的感染是乳牙根尖周病最主要的來源，其次是牙齒遭受外力的損傷，如跌倒。碰傷、打擊對牙的傷害，以及牙髓治療過程中藥物或充壊材料使用不當等造成根尖周組織的嚴重損害。
在牙髓感染中，牙炎症，特別是牙髓壞死後，細菌及其毒素、組織分齲產物可通過根尖孔到達根尖周組織。或通過髓室底的副根管到達根分歧部位的根周組織而引起根尖周病。根管內的感染是以厭氣菌為主體的混合感染。感染根管內可產生許多物質，其中主要是內毒素和各種侵襲性酶，它們具有強致炎作用和導致組織崩齲和破壞的能力。
乳牙牙保治療中，三氧化二神和醛酚樹脂液是不宜用的，它們對根尖周組織可造成嚴重的化學性損傷，有時其至傷害到恒牙牙胚。
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