牙髓和牙本質在胚胎發育過程中，共同起源於外胚間充質，稱為牙髓牙本質複合體。當牙本質受到外界刺激時，可引起牙本質小管內液體迅速流動，牙髓內神經末梢被激惹，產生疼痛。
淺的齲壞未達釉牙本質界時，鑽牙備洞可沒有或僅有極輕微的感覺。當齲洞已達釉牙本質界或更深層時，即使未露“神經”，鑽牙產熱及過度吹幹、冷水剌激等都可以刺激牙本質引起牙髓的疼痛反應。牙本質出現的這種疼痛很尖銳，時間短暫。主要原因與牙本質小管記憶體在神經末梢有關，但具體的疼痛機制尚不十分清楚。鑽至深層牙本質時一般會出現明顯的酸痛刺激症狀，這時可根據患者意願在局部麻醉下進行無痛操作,有時在治療時讓患者聽聽音樂可使緊張的心情得到放鬆。
目前，已有一些化學去齲、不需牙鑽的新方法推出，這在很大程度上減少了患者對鑽牙的恐懼感。
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